Kute Telaga Mekar adalah Salah Kute tertua yang ada di kabupaten Aceh Tenggara dan sudah berdiri pada masa penjajahan kolonial Belanda dan Jepang,Kute Telaga Mekar sendiri pada masa penjajahan menjadi Central dan pusat pendidikan Agama Islam pertama di Aceh Tenggara. Kute Telaga sendiri sejarah pemerintahannya sempat tergabung ke Desa Kutabantil Gabungan Pada masa itu,  dan dengan adanya Program Pemekaran Desa pada tahun 2003 dari pemerintah Daerah Kabupaten Aceh Tenggara, Kute Telaga Mekar menjadi Desa Defenitip pada Tahun 2003.